室间质评综合办公室是临检中心的主要职能科室，负责室间质量评价计划等工作的总体组织协调，并运行室间质量评价计划（新生儿遗传代谢病筛查、产前筛查和诊断）14项。
负责起草和发布多项国家标准和行业标准，其中包括：GB/T 20468-2006《临床实验室定量测定室内质量控制指南》、GB/T 20470-2006《临床实验室室间质量评价要求》、WS/T 414-2013 《室间质量评价结果应用指南》、WS/T 415-2013 《无室间质量评价时实验室检测评估方法》、WS/T 496-2017《临床实验室质量指标》、WS/T 641-2018《临床检验定量测定室内质量控制》、WS/T 644-2018《临床检验室间质量评价》。
为提高临床检验的质量水平，还在下列方面做了相关研究，并组织全国性学术会议：临床检验室内质量控制方法、临床检验室间质量评价方法、临床检验方法确认与性能验证、临床实验室质量管理与控制指标体系、临床实验室质量指标规范、临床实验室六西格玛质量管理、临床实验室风险管理、产前筛查和诊断室间质量评价工作，以及新生儿遗传代谢病筛查和诊断室间质量评价工作。曾获得中华医学科技奖、中国医院协会医院科技创新奖、中国出生缺陷干预救助基金会科学技术奖、北京医院院级科技成果奖等多个奖项。
国家卫生健康委临床检验中心是1982年1月20日经卫生部正式批准成立，由卫生部北京医院代管的事业单位
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